Государственная коллекция фитопатогенных микроорганизмов и сортов растений-идентификаторов патогенных штаммов микроорганизмов

    Коллекция создана более полувека назад. Постановлением Правительства РФ №725-47с от 24.06.1996г. коллекция была включена в «Перечень коллекций, депонирующих для государственных нужд микроорганизмы как «Государственная коллекция фитопатогенных микроорганизмов и сортов растений-идентификаторов патогенных штаммов микроорганизмов» на базе Всероссийского научно-исследовательского института фитопатологии.
    Коллекция имеет статус государственного депозитария и является единственным в России в соответствии с Постановлением Правительства РФ координирующим центром по сбору, депонированию и хранению фитопатогенных микроорганизмов, непатогенных для человека и сельскохозяйственных животных, и используемых в агропромышленном комплексе РФ (защите растений, растениеводстве, селекции, биотехнологии, научных исследованиях и т.д.).
    В настоящее время Государственная коллекция насчитывает более 5000 единиц хранения патогенных для растений штаммов, изолятов и образцов возбудителей наиболее вредоносных болезней относящихся к грибам, бактериям, вирусам, вироидам, фитоплазмам и нематодам, поражающим основные сельскохозяйственные культуры России: пшеницу, рожь, овес, ячмень, рис, картофель, овощи, некоторые технические культуры.
    В работу Государственной коллекции внедрена система электронного учета приема, движения и выдачи коллекционных единиц хранения с использованием компьютерной Системы контроля патогенных материалов (PACS), которая обеспечивает возможность отслеживать весь путь движения каждого штамма от его поступления в Государственную коллекцию до отправки заказчикам или выбраковки при потере им биологических свойств. На каждый хранящийся фитопатогенный штамм Коллекции заведена компьютерная информационная карта (паспорт) с указанием различных свойств штамма.

Задачи Государственной Коллекции:

• Формирование, пополнение и централизованное гарантийное хранение актива коллекционных штаммов микроорганизмов, возбудителей наиболее опасных болезней экономически важных сельскохозяйственных культур, поддержание в жизнеспособном и биологически чистом состоянии всех штаммов, взятых на учет, сортов и линий растений-идентификаторов (дифференциаторов) патогенных штаммов.
• Обеспечение проведения фитопатологических, генетических, иммунологических, токсикологических и других, в том числе фундаментальных исследований, с целью разработки современных методов мониторинга эпидемий и их контроля.
• Составление каталогов коллекционных образцов фитопатогенных микроорганизмов с характеристикой их диагностических признаков, патогенных и вирулентных свойств и других показателей, указанных в информационной карте (паспорте) коллекционного образца.
• Пополнение коллекции новыми стабильными по всем признакам видами и штаммами фитопатогенных микроорганизмов, выделенными из образцов пораженных растений, доставленных из различных зон РФ природных или производственных экосистем, поступивших из рабочих коллекций отделов, лабораторий и групп института, а также полученных по обмену из российских и зарубежных коллекций.
• Совершенствование методов выделения, идентификации, размножения, хранения и генотипирования фитопатогенных микроорганизмов.
• Наработка патотипов и обеспечение биоматериалом селекционных центров, научно-исследовательских учреждений и других потребителей по их заявкам для проведения фитопатологических, генетических, иммунологических, токсикологических и других, в том числе фундаментальных исследований с целью разработки современных методов мониторинга эпидемий и их контроля.
• Учет, в том числе и компьютерный, поступления коллекционных образцов фитопатогенных культур, их движения в институте, рассылка заказчикам и выбраковка штаммов, потерявших жизнеспособность или патогенные свойства.
• Консервация и централизованное хранение генетически разнообразных штаммов фитопатогенных микроорганизмов.
• Обеспечение надежной физической защитой и системой биобезопасности хранящихся штаммов и другого биоматериала.

Коллекция используется для решения следующих вопросов фундаментальных и прикладных исследований:

• изучение изменений во времени и пространстве структур популяций  в разных регионах России с целью прогноза опасных фитосанитарных ситуаций;
• мониторинг появления новых вирулентных патотипов; определение регионов их происхождения;
• изучение систем взаимодействия хозяин-патоген, полиморфизма видов, внутроивидовых таксонов и популяций с использованием молекулярно-генетических и биохимических методов (ПЦР, РАПД – анализ, ИФА и др.);
• изучение структур ДНК, структур и функций отдельных генов, а также участков генов для решения задач таксономии, систематики, идентификации, фитосанитарных прогнозов;
• тестирование генов устойчивости в исходном селекционном материале с использованием маркерных коллекций для оптимизации селекции на иммунитет;
• мониторинг динамики резистентности популяций и отдельных патотипов к препаратам из различных химических классов с целью своевременного внесения изменений в стратегию защиты от болезней;
• прогноз длительности сохранения устойчивости районированных и предлагаемых к районированию сортов на основе контроля динамики вирулентных рас и патотипов;
• обоснование состава искусственных инфекционных фонов для разных регионов с использованием генетического разнообразия коллекционных штаммов.

Сотрудники

Методические рекомендации хранения штаммов
Каталог штаммов

/vniif/structure/collection/page/1367